Apport de l’instrument FilmArray dans le diagnostic rapide ( par approche syndromique par PCR) des urgences infectieuses : Sepsis, Méningites et Encéphalites

Abstract

Les méningites et les encéphalites infectieuses représentent actuellement un véritable challenge diagnostique et thérapeutique du fait d’une mortalité, de séquelles et d’un coût socio-économique important, La bactériémie est une pathologie grave potentiellement mortelle, elle est associée à un grand nombre d’hospitalisation, un coût élevé et à une surconsommation d’antibiotiques. Une rapide identification des pathogènes en cause est cruciale pour diminuer le fardeau sanitaire. Le développement récent des nouveaux tests de diagnostic rapide par PCR multiplexe à visée syndromique, capables de détecter plusieurs pathogènes en quelques heures, a entraîné un changement de paradigme en microbiologie et en pratique clinique. Objectif : Notre étude vise à évaluer l’impact de la méthode multiplex FilmArray dans le diagnostic et la prise en charge des Bactériémies ; Méningites et les encéphalites au Malien. Méthodes : Il s’agit d’une étude prospective de type descriptive et analytique qui a été réalisée sur 56 prélèvements provenant de patients cliniquement suspects de bactériémies ; méningites et des encéphalites analysés par méthodes classiques et par le PCR FilmArray. Ce travail a duré 27 mois de Janvier 2020 à Mars 202 Résultats : Durant la période de l’étude,56 échantillons ont été documentés. Les prélèvements provenaient en grande partie des patients hospitalisés au niveau du service de la réanimation du CHU Point G avec un taux de 50% de notre échantillon suivi du service de la réanimation du CHU le Luxembourg avec un taux de 30,4%. Une prédominance masculine a été notée avec une sex-ratio H/F de 1.2. Le taux de positivité par le FilmArray de 57,1%. Nous avons détecté un taux de co-infection de17,9%. Une étiologie bactérienne a été retrouvée chez 54% des patients, prédominée par le E. Coli avec un taux de positivité de 23,1%., les levures sont minoritaires avec 7% d’échantillons positifs et les virus représentaient 11%. Le délai de rendu de résultat était de : 6 heures pour le panel FilmArray 120 heures pour les méthodes conventionnelles. Conclusion : Le panel FilmArray BCID et le panel M/E est un outil de diagnostic simple, rapide et fiable permettant la mise en oeuvre d’une stratégie thérapeutique précoce et adaptée et l’amélioration de l’ensemble du parcours de soins. Toutefois, compte tenu de l’importance de l’antibiogramme, l’utilisation des tests moléculaires devrait être réalisée en complément de la microbiologie conventionnelle. Par ailleurs, Les résultats devraient toujours s’interpréter en fonction du contexte clinico- épidémiologique et en association avec l’ensemble des examens biologiques.